ひとまずは SRPM をとってきて spec みてどう configure してるのか分かったので解決。
その後、なんでだろなーと思って調べてみたら、ext/standard/info.c にパッチがあたっていた。下記行をコメントアウトするパッチ。
#ifdef CONFIGURE_COMMAND php_info_print_table_row(2, "Configure Command", CONFIGURE_COMMAND ); #endif
あとでわかったのが、php-devel いれれば php-config でみれるな。
あまりみる必要となることもないけど覚えておこう。
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